Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSR3Q9UNL2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSR3Q9UNL2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSR3Q9UNL2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSR3Q9UNL2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSR3Q9UNL2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSR3Q9UNL2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSR3Q9UNL2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSR3Q9UNL2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms