Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms