Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms