Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms