Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APEX2Q9UBZ4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms