Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms