Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms