Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GORASP1Q9BQQ3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms