Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms