Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5Q99717 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms