Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms