Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms