Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms