Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms