Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms