Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms