Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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