Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LNX2Q8N448 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms