Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CATSPER4Q7RTX7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms