Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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