Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms