Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms