Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEXMIFQ5QGS0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEXMIFQ5QGS0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEXMIFQ5QGS0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEXMIFQ5QGS0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEXMIFQ5QGS0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEXMIFQ5QGS0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEXMIFQ5QGS0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEXMIFQ5QGS0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEXMIFQ5QGS0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms