Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms