Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN52Q52LA3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms