Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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