Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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RTN1Q16799 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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