Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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