Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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