Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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