Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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