Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PKP1Q13835 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PKP1Q13835 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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