Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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NCOA4Q13772 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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NCOA4Q13772 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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NCOA4Q13772 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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