Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BFSP2Q13515 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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