Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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NFIAQ12857 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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NFIAQ12857 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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NFIAQ12857 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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NFIAQ12857 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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NFIAQ12857 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NFIAQ12857 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NFIAQ12857 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NFIAQ12857 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NFIAQ12857 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NFIAQ12857 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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