Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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KCNMA1Q12791 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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KCNMA1Q12791 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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