Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC8Q09428 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC8Q09428 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms