Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms