Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms