Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms