Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BDH1Q02338 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BDH1Q02338 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BDH1Q02338 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms