Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms