Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms