Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms