Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP46P62068 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP46P62068 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP46P62068 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
USP46P62068 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP46P62068 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP46P62068 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP46P62068 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP46P62068 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP46P62068 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP46P62068 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms