Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms