Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAEP38570 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms