Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA4P35212 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA4P35212 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA4P35212 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA4P35212 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA4P35212 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA4P35212 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA4P35212 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA4P35212 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA4P35212 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA4P35212 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms