Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms