Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms